Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD47Q08722 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD47Q08722 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD47Q08722 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD47Q08722 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD47Q08722 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD47Q08722 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD47Q08722 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD47Q08722 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD47Q08722 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms