Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN1BQ07699 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms