Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREMQ03060 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREMQ03060 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREMQ03060 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREMQ03060 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREMQ03060 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CREMQ03060 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREMQ03060 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms