Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCNT1Q02742 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms