Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN2Q02246 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms