Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms