Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFITM3Q01628 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms