Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRF9Q00978 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms