Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLCB2Q00722 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLCB2Q00722 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms