Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCCQ00597 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms