Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms