Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKD1P98161 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKD1P98161 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PKD1P98161 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PKD1P98161 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKD1P98161 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PKD1P98161 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PKD1P98161 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PKD1P98161 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PKD1P98161 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PKD1P98161 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PKD1P98161 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PKD1P98161 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PKD1P98161 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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