Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms