Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113P62684 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms