Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RORCP51449 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RORCP51449 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RORCP51449 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RORCP51449 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms