Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1A1P48729 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1A1P48729 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms