Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCLCP48506 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCLCP48506 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCLCP48506 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCLCP48506 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCLCP48506 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms