Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDH1P40925 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MDH1P40925 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MDH1P40925 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MDH1P40925 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDH1P40925 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDH1P40925 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDH1P40925 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDH1P40925 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDH1P40925 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDH1P40925 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms