Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT9P35527 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT9P35527 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT9P35527 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT9P35527 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT9P35527 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT9P35527 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT9P35527 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT9P35527 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT9P35527 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms