Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPS1P31327 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPS1P31327 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPS1P31327 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPS1P31327 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPS1P31327 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPS1P31327 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPS1P31327 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPS1P31327 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPS1P31327 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CPS1P31327 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CPS1P31327 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CPS1P31327 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPS1P31327 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPS1P31327 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPS1P31327 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPS1P31327 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPS1P31327 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPS1P31327 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPS1P31327 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPS1P31327 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPS1P31327 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPS1P31327 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPS1P31327 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPS1P31327 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms