Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTGFP29279 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTGFP29279 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTGFP29279 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTGFP29279 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTGFP29279 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTGFP29279 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTGFP29279 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTGFP29279 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms