Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB4P28070 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB4P28070 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms