Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA3P25788 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms