Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCMT1P22061 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCMT1P22061 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms