Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF3P20783 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF3P20783 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF3P20783 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms