Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRHP20396 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRHP20396 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRHP20396 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRHP20396 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRHP20396 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRHP20396 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TRHP20396 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRHP20396 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRHP20396 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRHP20396 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRHP20396 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRHP20396 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRHP20396 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TRHP20396 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TRHP20396 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRHP20396 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRHP20396 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRHP20396 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRHP20396 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRHP20396 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRHP20396 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRHP20396 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRHP20396 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRHP20396 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRHP20396 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TRHP20396 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TRHP20396 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRHP20396 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms