Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA6P17658 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA6P17658 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms