Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD46P15529 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD46P15529 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD46P15529 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CD46P15529 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD46P15529 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD46P15529 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD46P15529 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD46P15529 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD46P15529 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD46P15529 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms