Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CFTRP13569 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CFTRP13569 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CFTRP13569 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CFTRP13569 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CFTRP13569 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
CFTRP13569 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CFTRP13569 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CFTRP13569 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFTRP13569 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFTRP13569 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CFTRP13569 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFTRP13569 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFTRP13569 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CFTRP13569 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFTRP13569 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFTRP13569 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFTRP13569 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFTRP13569 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFTRP13569 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CFTRP13569 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFTRP13569 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFTRP13569 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CFTRP13569 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFTRP13569 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFTRP13569 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFTRP13569 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFTRP13569 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFTRP13569 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CFTRP13569 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CFTRP13569 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CFTRP13569 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms