Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL5P13501 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL5P13501 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL5P13501 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL5P13501 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL5P13501 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL5P13501 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL5P13501 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL5P13501 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL5P13501 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL5P13501 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL5P13501 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL5P13501 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL5P13501 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL5P13501 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms