Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL11A1P12107 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms