Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM17P0DL12 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM17P0DL12 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM17P0DL12 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM17P0DL12 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM17P0DL12 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM17P0DL12 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms