Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP10P09238 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP10P09238 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP10P09238 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP10P09238 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP10P09238 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP10P09238 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP10P09238 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP10P09238 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP10P09238 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms