Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAP2AP05549 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAP2AP05549 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms