Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC1P02654 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC1P02654 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC1P02654 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC1P02654 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC1P02654 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC1P02654 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms