Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
COL4A1P02462 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A1P02462 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms