Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms