Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR46O15213 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR46O15213 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR46O15213 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR46O15213 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR46O15213 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms