Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SETD1AO15047 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD1AO15047 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms