Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIP1O00291 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIP1O00291 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIP1O00291 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIP1O00291 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms