Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms