Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MEIS3P1A6NDR6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms