Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SHOC2Q9UQ13 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHOC2Q9UQ13 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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