Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF8Q9UPN6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAF8Q9UPN6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAF8Q9UPN6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms