Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSR3Q9UNL2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms