Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALKQ9UM73 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms