Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms