Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXL4Q9UKA2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL4Q9UKA2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms