Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCSK1NQ9UHG2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms