Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NKX1-2Q9UD57 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms